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    qPCR軟件報錯了?別慌,這篇文章會給你答案!

    在運行qPCR實驗或分析數(shù)據(jù)時,有時候會遇到軟件報錯,小編在這里列舉了Applied BiosystemsTM 品牌儀器軟件的常見報錯,分析了可能的原因和解決辦法,如果您正在使用我們的儀器,希望本文能給您提供一些解決軟件報錯問題的思路。


    一、通用報錯(多款機型軟件均可能出現(xiàn))
    1. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報錯:java.lang.IIIegalArgumentException: One of the raw spectra is null。點擊OK接受后,擴增曲線是空白(如圖stepone plus軟件)。
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    問題分析:

    可能是單次數(shù)據(jù)異常,導(dǎo)致校正文件丟失。在軟件上點擊Analysis  > override calibration > Use another calibration file 下選擇同儀器相同類型實驗文件做校正 ,重新分析后可以恢復(fù)正常數(shù)據(jù)。出現(xiàn)該報錯的原因可能是雙擊了start run, 或者分析/保存數(shù)據(jù)過程被中斷,例如分析/保存過程中關(guān)閉軟件或拔出U盤。

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    2. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報錯:Analysis cannot proceed: not enough sample definded(如圖stepone plus軟件,此報錯僅限stepone,stepone plus,7300 plus,7500 v2.0以上版本軟件)。

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    問題分析:

    plate setup步驟未給樣品孔設(shè)置sample信息,設(shè)置好sample信息后重新分析,數(shù)據(jù)可以恢復(fù)正常。

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    3. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報錯:Analysis cannot proceed: not enough targets definded(如圖stepone plus軟件,此報錯僅限stepone,stepone plus,7300 plus,7500 v2.0以上版本軟件)。

    圖片

    問題分析:

    plate setup步驟未給樣品孔設(shè)置target信息,設(shè)置好target信息后重新分析,數(shù)據(jù)可以恢復(fù)正常。

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    4. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報錯:Analysis failed due to: GExSession doesn't exist in context。點擊OK  接受后,擴增曲線是空白(如圖stepone plus軟件)。

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    問題分析:

    擴增循環(huán)階段未采集信號,需要打開信號收集標(biāo)識。

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    5. 在多重反應(yīng)程序設(shè)置中,給樣品孔添加ROX作為reportor 的探針時,報錯:Dye "ROX" already used in passive reference(如圖Q5軟件)。

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    問題分析:

    儀器默認(rèn)passive reference選擇ROX作為參比熒光,如果實驗中ROX是作為探針的報告基團,則需要將passive reference改成None,之后就可以在target設(shè)置中選擇ROX作為探針了。


    6. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報錯:The selected file cannot be opened, cannot open the file because file contents are not recognized(如圖Q5軟件)。

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    問題分析:

    可能的原因包括: 

    1. 通過導(dǎo)入文件(import plate setup)在實驗中添加了重復(fù)的樣本,使用了相同的sample name,建議編輯樣品名稱時不要使用相同的sample name 命名樣品。

    2. 實驗名稱包含不合要求的字符,例如空格,括號等,建議實驗名稱不要使用不符要求的字符。

    3. 文件受損,數(shù)據(jù)不完整,建議儀器運行過程中不要操作軟件。

    4. 拷貝數(shù)據(jù)的U盤有故障,導(dǎo)致拷貝數(shù)據(jù)不完整,建議更換U盤重新拷貝數(shù)據(jù)。


    二、7500報錯

    1. 運行程序時報錯:1404  Hold duration too short for read。

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    問題分析:

    數(shù)據(jù)采集時間太短,PCR循環(huán)階段data collection step 時間設(shè)置不小于31秒,melt curve 階段data collection step請勿修改。


    2. 運行程序時報錯:Java Platform SE Binary has stopped working,實驗中斷。

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    問題分析:

    如果通過直接雙擊已保存的edt模板文件去運行實驗程序,可能會出現(xiàn)報錯。建議先打開7500軟件,通過New Experiment > From Template導(dǎo)入edt文件進行實驗。


    3. 點擊start run時報錯"The instrument type for the experiment is not compatible with the connected instrument"。

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    問題分析:

    實驗中選擇的儀器類型與實際使用的儀器不符,需要到Setup界面重新修改為正確的儀器類型。

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    4. 程序設(shè)置報黃色提醒 "number of data collection points is not valid"

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    問題分析:

    運行程序設(shè)置了多個信號采集點,定量實驗中只能設(shè)置一個信號采集點,可以設(shè)置在cycling stage 。


    5. eds文件導(dǎo)入PTS軟件,報錯"cannot import any experiment file(s) because of the following error(s): "

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    問題分析:

    使用7500 v2.4版本軟件產(chǎn)生的數(shù)據(jù)與PTS軟件不兼容,可以將eds數(shù)據(jù)先用7500 v2.3的軟件打開,分析后保存,然后再導(dǎo)入PTS軟件。


    三、Q3/5報錯

    1. 數(shù)據(jù)打開后擴增曲線是空白,點擊Analyze分析后報錯:The analysis cannot proceed because the experiment is missing required plate setup information. Go to 'Define' and 'Assign' page to creat and assign targets and samples. 點擊OK接受后,擴增曲線仍是空白。

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    問題分析:

    plate setup步驟未給樣品孔設(shè)置target或者sample name信息,設(shè)置好target或者sample name信息后重新分析,數(shù)據(jù)可以恢復(fù)正常。

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    2. 運行PTS實驗報錯:Star run validation: The filter set has not been selected for following target: ROX(x4-m4)。

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    問題分析:

    含melt curve的實驗程序中,軟件默認(rèn)melt curve filter只選擇X1M1,PTS實驗需要從軟件進入Method-action-optical filter settings, 在melt curve filter選項中將x4m4選中(Q5也可以嘗試x1m3)。

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    3. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報錯:Analysis failed due to insufficient data。

    問題分析:

    1.4.3之前版本的軟件有bug, 部分染料法實驗結(jié)果擴增曲線是空白,解決方法是在analysis setting 點擊apply,即可恢復(fù)正常顯示。1.4.3之后的軟件版本無此問題。

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    四、stepone/stepone plus 報錯

    1. 開始運行實驗前報錯:You must first download experiment"XXX"before you can start another run on  this instrument.  

    問題分析:

    上次運行實驗沒有正常傳輸?shù)诫娔X端,需先將上次實驗數(shù)據(jù)下載到電腦然后才能開始運行。在軟件上點擊Instrument > Download Experiment from Instrument下載數(shù)據(jù)后,即可重新開始運行試驗。

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    2. 打開數(shù)據(jù)點擊analyze分析軟件報錯:Cannot calculate Pure Dye Matrix。

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    問題分析:

    該報錯指示運行結(jié)果文件中有原始數(shù)據(jù)丟失,可能是實驗程序沒有運行結(jié)束或在運行過程中被終止所導(dǎo)致。例如客戶將反應(yīng)程序最后一步設(shè)置為infinite holding stage,最后通過點擊STOP結(jié)束程序容易導(dǎo)致該問題。針對這樣的數(shù)據(jù),可以聯(lián)系技術(shù)支持尋求幫助。


    3. 查看熔解曲線時出現(xiàn)黃色報錯:No derivative curve for all selected wells due to excessive noise in fluorescence data.

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    問題分析:

    熔解曲線程序設(shè)置錯誤,如下圖中數(shù)據(jù)誤刪掉了60度的步驟,設(shè)成了95度升溫到95.3度。建議使用SYBR Green染料法做實驗時,不要修改熔解曲線步驟,使用儀器默認(rèn)程序即可。

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